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PRO C 1 28 ? -1.793 2.511 8.176 1.00 25.03 ? 28 PRO C CA 1 ATOM 542 C C . PRO C 1 28 ? -1.275 2.469 6.741 1.00 28.02 ? 28 PRO C C 1 ATOM 543 O O . PRO C 1 28 ? -1.451 1.484 6.009 1.00 27.88 ? 28 PRO C O 1 ATOM 544 C CB . PRO C 1 28 ? -0.829 1.830 9.144 1.00 26.85 ? 28 PRO C CB 1 ATOM 545 C CG . PRO C 1 28 ? -1.496 0.647 9.735 1.00 25.17 ? 28 PRO C CG 1 ATOM 546 C CD . PRO C 1 28 ? -2.928 0.655 9.283 1.00 22.75 ? 28 PRO C CD 1 ATOM 547 N N . PRO C 1 29 ? -0.631 3.546 6.285 1.00 31.24 ? 29 PRO C N 1 ATOM 548 C CA . PRO C 1 29 ? 0.036 3.518 4.989 1.00 34.03 ? 29 PRO C CA 1 ATOM 549 C C . PRO C 1 29 ? 1.259 2.597 5.039 1.00 37.48 ? 29 PRO C C 1 ATOM 550 O O . PRO C 1 29 ? 1.836 2.394 6.116 1.00 39.59 ? 29 PRO C O 1 ATOM 551 C CB . PRO C 1 29 ? 0.536 4.948 4.773 1.00 37.19 ? 29 PRO C CB 1 ATOM 552 C CG . PRO C 1 29 ? -0.184 5.785 5.764 1.00 37.72 ? 29 PRO C CG 1 ATOM 553 C CD . PRO C 1 29 ? -0.481 4.872 6.928 1.00 36.16 ? 29 PRO C CD 1 ATOM 554 O OD1 . 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PRO B 1 11 ? -46.662 -2.681 31.298 1.00 10.43 ? 11 PRO B CA 1 HETATM 240 C C . PRO B 1 11 ? -46.417 -1.719 30.150 1.00 9.63 ? 11 PRO B C 1 HETATM 241 O O . PRO B 1 11 ? -47.119 -1.723 29.135 1.00 11.04 ? 11 PRO B O 1 HETATM 242 C CB . PRO B 1 11 ? -45.902 -4.003 31.082 1.00 13.25 ? 11 PRO B CB 1 HETATM 243 C CG . PRO B 1 11 ? -46.824 -5.060 31.570 1.00 11.97 ? 11 PRO B CG 1 HETATM 244 C CD . PRO B 1 11 ? -48.191 -4.561 31.198 1.00 13.73 ? 11 PRO B CD 1 HETATM 245 O OD1 . PRO B 1 11 ? -46.757 -5.152 32.964 1.00 13.97 ? 11 PRO B OD1 1 HETATM 246 N N . GLY B 1 12 ? -45.358 -0.893 30.312 1.00 8.78 ? 12 GLY B N 1 HETATM 247 C CA . GLY B 1 12 ? -44.987 0.011 29.230 1.00 9.22 ? 12 GLY B CA 1 HETATM 248 C C . GLY B 1 12 ? -44.444 -0.713 28.007 1.00 8.46 ? 12 GLY B C 1 HETATM 249 O O . GLY B 1 12 ? -44.180 -1.932 28.039 1.00 10.03 ? 12 GLY B O 1 HETATM 250 N N . LEU B 1 13 ? -44.271 0.034 26.930 1.00 9.44 ? 13 LEU B N 1 HETATM 251 C CA . LEU B 1 13 ? -43.678 -0.521 25.723 1.00 9.68 ? 13 LEU B CA 1 HETATM 252 C C . LEU B 1 13 ? -42.176 -0.695 25.888 1.00 9.14 ? 13 LEU B C 1 HETATM 253 O O . LEU B 1 13 ? -41.555 -0.097 26.797 1.00 8.57 ? 13 LEU B O 1 HETATM 254 C CB . LEU B 1 13 ? -43.998 0.360 24.523 1.00 15.30 ? 13 LEU B CB 1 HETATM 255 C CG . LEU B 1 13 ? -45.514 0.420 24.206 1.00 17.30 ? 13 LEU B CG 1 HETATM 256 C CD1 . LEU B 1 13 ? -45.718 1.443 23.125 1.00 21.07 ? 13 LEU B CD1 1 HETATM 257 C CD2 . LEU B 1 13 ? -46.087 -0.933 23.845 1.00 21.83 ? 13 LEU B CD2 1 HETATM 258 N N . PRO B 1 14 ? -41.564 -1.522 25.068 1.00 8.03 ? 14 PRO B N 1 HETATM 259 C CA . PRO B 1 14 ? -40.099 -1.648 25.179 1.00 7.54 ? 14 PRO B CA 1 HETATM 260 C C . PRO B 1 14 ? -39.368 -0.328 24.953 1.00 6.85 ? 14 PRO B C 1 HETATM 261 O O . PRO B 1 14 ? -39.846 0.573 24.252 1.00 9.14 ? 14 PRO B O 1 HETATM 262 C CB . PRO B 1 14 ? -39.776 -2.653 24.078 1.00 8.43 ? 14 PRO B CB 1 HETATM 263 C CG . PRO B 1 14 ? -41.028 -3.462 23.899 1.00 8.83 ? 14 PRO B CG 1 HETATM 264 C CD . PRO B 1 14 ? -42.112 -2.436 24.043 1.00 10.39 ? 14 PRO B CD 1 HETATM 265 O OD1 . PRO B 1 14 ? -41.139 -4.427 24.913 1.00 11.76 ? 14 PRO B OD1 1 HETATM 266 N N . GLY B 1 15 ? -38.168 -0.234 25.543 1.00 7.71 ? 15 GLY B N 1 HETATM 267 C CA . GLY B 1 15 ? -37.373 0.952 25.368 1.00 7.96 ? 15 GLY B CA 1 HETATM 268 C C . GLY B 1 15 ? -36.849 1.144 23.960 1.00 8.39 ? 15 GLY B C 1 HETATM 269 O O . GLY B 1 15 ? -36.969 0.245 23.122 1.00 8.65 ? 15 GLY B O 1 HETATM 270 N N . LEU B 1 16 ? -36.283 2.333 23.665 1.00 8.00 ? 16 LEU B N 1 HETATM 271 C CA . LEU B 1 16 ? -35.656 2.581 22.404 1.00 8.13 ? 16 LEU B CA 1 HETATM 272 C C . LEU B 1 16 ? -34.456 1.648 22.232 1.00 8.11 ? 16 LEU B C 1 HETATM 273 O O . LEU B 1 16 ? -33.849 1.239 23.211 1.00 9.29 ? 16 LEU B O 1 HETATM 274 C CB . LEU B 1 16 ? -35.114 4.020 22.414 1.00 10.01 ? 16 LEU B CB 1 HETATM 275 C CG . LEU B 1 16 ? -36.145 5.145 22.377 1.00 9.45 ? 16 LEU B CG 1 HETATM 276 C CD1 . LEU B 1 16 ? -35.619 6.498 22.844 1.00 11.88 ? 16 LEU B CD1 1 HETATM 277 C CD2 . LEU B 1 16 ? -36.644 5.248 20.946 1.00 15.32 ? 16 LEU B CD2 1 HETATM 278 N N . PRO B 1 17 ? -34.098 1.364 20.998 1.00 8.98 ? 17 PRO B N 1 HETATM 279 C CA . PRO B 1 17 ? -32.843 0.643 20.818 1.00 9.93 ? 17 PRO B CA 1 HETATM 280 C C . PRO B 1 17 ? -31.665 1.490 21.283 1.00 9.80 ? 17 PRO B C 1 HETATM 281 O O . PRO B 1 17 ? -31.746 2.733 21.264 1.00 11.49 ? 17 PRO B O 1 HETATM 282 C CB . PRO B 1 17 ? -32.718 0.553 19.288 1.00 13.66 ? 17 PRO B CB 1 HETATM 283 C CG . PRO B 1 17 ? -34.135 0.666 18.815 1.00 13.88 ? 17 PRO B CG 1 HETATM 284 C CD . PRO B 1 17 ? -34.764 1.686 19.747 1.00 12.47 ? 17 PRO B CD 1 HETATM 285 O OD1 . PRO B 1 17 ? -34.822 -0.560 18.960 1.00 14.42 ? 17 PRO B OD1 1 HETATM 286 N N . GLY B 1 18 ? -30.594 0.825 21.647 1.00 9.92 ? 18 GLY B N 1 HETATM 287 C CA . GLY B 1 18 ? -29.352 1.508 22.027 1.00 9.06 ? 18 GLY B CA 1 HETATM 288 C C . GLY B 1 18 ? -28.696 2.201 20.862 1.00 8.33 ? 18 GLY B C 1 HETATM 289 O O . GLY B 1 18 ? -29.104 1.992 19.700 1.00 8.89 ? 18 GLY B O 1 HETATM 290 N N . PRO B 1 19 ? -27.679 3.010 21.145 1.00 9.23 ? 19 PRO B N 1 HETATM 291 C CA . PRO B 1 19 ? -26.969 3.673 20.044 1.00 9.07 ? 19 PRO B CA 1 HETATM 292 C C . PRO B 1 19 ? -26.088 2.695 19.269 1.00 8.74 ? 19 PRO B C 1 HETATM 293 O O . PRO B 1 19 ? -25.901 1.550 19.717 1.00 8.69 ? 19 PRO B O 1 HETATM 294 C CB . PRO B 1 19 ? -26.039 4.672 20.761 1.00 12.13 ? 19 PRO B CB 1 HETATM 295 C CG . PRO B 1 19 ? -25.827 4.048 22.109 1.00 12.83 ? 19 PRO B CG 1 HETATM 296 C CD . PRO B 1 19 ? -27.114 3.345 22.468 1.00 12.22 ? 19 PRO B CD 1 HETATM 297 N N . PRO B 1 20 ? -25.581 3.108 18.108 1.00 8.68 ? 20 PRO B N 1 HETATM 298 C CA . PRO B 1 20 ? -24.678 2.284 17.327 1.00 8.17 ? 20 PRO B CA 1 HETATM 299 C C . PRO B 1 20 ? -23.478 1.905 18.205 1.00 8.05 ? 20 PRO B C 1 HETATM 300 O O . PRO B 1 20 ? -23.107 2.604 19.127 1.00 10.02 ? 20 PRO B O 1 HETATM 301 C CB . PRO B 1 20 ? -24.241 3.182 16.169 1.00 10.47 ? 20 PRO B CB 1 HETATM 302 C CG . PRO B 1 20 ? -25.376 4.164 16.048 1.00 12.42 ? 20 PRO B CG 1 HETATM 303 C CD . PRO B 1 20 ? -25.846 4.403 17.462 1.00 10.51 ? 20 PRO B CD 1 HETATM 304 O OD1 . PRO B 1 20 ? -26.410 3.614 15.268 1.00 14.37 ? 20 PRO B OD1 1 HETATM 305 N N . GLY B 1 21 ? -22.881 0.764 17.847 1.00 7.58 ? 21 GLY B N 1 HETATM 306 C CA . GLY B 1 21 ? -21.697 0.323 18.526 1.00 7.51 ? 21 GLY B CA 1 HETATM 307 C C . GLY B 1 21 ? -20.492 1.179 18.183 1.00 8.13 ? 21 GLY B C 1 HETATM 308 O O . GLY B 1 21 ? -20.565 2.078 17.350 1.00 9.91 ? 21 GLY B O 1 HETATM 309 N N . PRO B 1 22 ? -19.375 0.906 18.844 1.00 9.51 ? 22 PRO B N 1 HETATM 310 C CA . PRO B 1 22 ? -18.136 1.651 18.565 1.00 10.09 ? 22 PRO B CA 1 HETATM 311 C C . PRO B 1 22 ? -17.608 1.406 17.158 1.00 10.01 ? 22 PRO B C 1 HETATM 312 O O . PRO B 1 22 ? -17.886 0.386 16.511 1.00 9.82 ? 22 PRO B O 1 HETATM 313 C CB . PRO B 1 22 ? -17.133 1.106 19.572 1.00 11.25 ? 22 PRO B CB 1 HETATM 314 C CG . PRO B 1 22 ? -17.735 -0.101 20.154 1.00 14.15 ? 22 PRO B CG 1 HETATM 315 C CD . PRO B 1 22 ? -19.208 -0.113 19.871 1.00 9.41 ? 22 PRO B CD 1 HETATM 316 N N . PRO B 1 23 ? -16.812 2.336 16.625 1.00 10.48 ? 23 PRO B N 1 HETATM 317 C CA . PRO B 1 23 ? -16.224 2.077 15.321 1.00 10.25 ? 23 PRO B CA 1 HETATM 318 C C . PRO B 1 23 ? -15.323 0.848 15.378 1.00 8.86 ? 23 PRO B C 1 HETATM 319 O O . PRO B 1 23 ? -14.746 0.471 16.399 1.00 11.62 ? 23 PRO B O 1 HETATM 320 C CB . PRO B 1 23 ? -15.411 3.331 15.038 1.00 13.85 ? 23 PRO B CB 1 HETATM 321 C CG . PRO B 1 23 ? -16.038 4.381 15.916 1.00 12.41 ? 23 PRO B CG 1 HETATM 322 C CD . PRO B 1 23 ? -16.422 3.636 17.167 1.00 11.37 ? 23 PRO B CD 1 HETATM 323 O OD1 . PRO B 1 23 ? -17.209 4.871 15.307 1.00 14.10 ? 23 PRO B OD1 1 HETATM 324 N N . GLY B 1 24 ? -15.264 0.221 14.206 1.00 9.29 ? 24 GLY B N 1 HETATM 325 C CA . GLY B 1 24 ? -14.383 -0.927 14.099 1.00 10.00 ? 24 GLY B CA 1 HETATM 326 C C . GLY B 1 24 ? -12.921 -0.541 14.135 1.00 10.61 ? 24 GLY B C 1 HETATM 327 O O . GLY B 1 24 ? -12.539 0.627 14.079 1.00 12.31 ? 24 GLY B O 1 HETATM 328 N N . PRO B 1 25 ? -12.036 -1.545 14.225 1.00 11.23 ? 25 PRO B N 1 HETATM 329 C CA . PRO B 1 25 ? -10.614 -1.289 14.170 1.00 12.04 ? 25 PRO B CA 1 HETATM 330 C C . PRO B 1 25 ? -10.122 -0.688 12.856 1.00 12.28 ? 25 PRO B C 1 HETATM 331 O O . PRO B 1 25 ? -10.811 -0.805 11.845 1.00 11.59 ? 25 PRO B O 1 HETATM 332 C CB . PRO B 1 25 ? -10.049 -2.720 14.299 1.00 16.38 ? 25 PRO B CB 1 HETATM 333 C CG . PRO B 1 25 ? -11.126 -3.505 14.994 1.00 15.87 ? 25 PRO B CG 1 HETATM 334 C CD . PRO B 1 25 ? -12.387 -2.961 14.387 1.00 12.15 ? 25 PRO B CD 1 HETATM 335 N N . PRO B 1 26 ? -8.953 -0.049 12.857 1.00 13.52 ? 26 PRO B N 1 HETATM 336 C CA . PRO B 1 26 ? -8.358 0.332 11.572 1.00 13.21 ? 26 PRO B CA 1 HETATM 337 C C . PRO B 1 26 ? -8.164 -0.901 10.700 1.00 11.96 ? 26 PRO B C 1 HETATM 338 O O . PRO B 1 26 ? -7.959 -1.995 11.207 1.00 14.34 ? 26 PRO B O 1 HETATM 339 C CB . PRO B 1 26 ? -6.993 0.892 11.951 1.00 15.18 ? 26 PRO B CB 1 HETATM 340 C CG . PRO B 1 26 ? -7.132 1.338 13.355 1.00 14.75 ? 26 PRO B CG 1 HETATM 341 C CD . PRO B 1 26 ? -8.123 0.393 13.994 1.00 15.92 ? 26 PRO B CD 1 HETATM 342 O OD1 . PRO B 1 26 ? -7.653 2.641 13.384 1.00 21.85 ? 26 PRO B OD1 1 HETATM 343 N N . GLY B 1 27 ? -8.248 -0.692 9.399 1.00 12.21 ? 27 GLY B N 1 HETATM 344 C CA . GLY B 1 27 ? -8.055 -1.708 8.400 1.00 13.46 ? 27 GLY B CA 1 HETATM 345 C C . GLY B 1 27 ? -6.628 -2.205 8.347 1.00 13.29 ? 27 GLY B C 1 HETATM 346 O O . GLY B 1 27 ? -5.751 -1.740 9.046 1.00 15.67 ? 27 GLY B O 1 HETATM 347 N N . PRO B 1 28 ? -6.414 -3.227 7.527 1.00 16.35 ? 28 PRO B N 1 HETATM 348 C CA . PRO B 1 28 ? -5.068 -3.829 7.467 1.00 17.85 ? 28 PRO B CA 1 HETATM 349 C C . PRO B 1 28 ? -4.058 -2.831 6.929 1.00 21.53 ? 28 PRO B C 1 HETATM 350 O O . PRO B 1 28 ? -4.414 -1.863 6.254 1.00 20.05 ? 28 PRO B O 1 HETATM 351 C CB . PRO B 1 28 ? -5.234 -5.016 6.531 1.00 19.10 ? 28 PRO B CB 1 HETATM 352 C CG . PRO B 1 28 ? -6.684 -5.086 6.174 1.00 19.54 ? 28 PRO B CG 1 HETATM 353 C CD . PRO B 1 28 ? -7.401 -3.870 6.668 1.00 18.36 ? 28 PRO B CD 1 HETATM 354 N N . PRO B 1 29 ? -2.780 -3.034 7.225 1.00 24.14 ? 29 PRO B N 1 HETATM 355 C CA . PRO B 1 29 ? -1.754 -2.130 6.687 1.00 25.46 ? 29 PRO B CA 1 HETATM 356 C C . PRO B 1 29 ? -1.706 -2.211 5.170 1.00 28.59 ? 29 PRO B C 1 HETATM 357 O O . PRO B 1 29 ? -2.096 -3.202 4.545 1.00 28.12 ? 29 PRO B O 1 HETATM 358 C CB . PRO B 1 29 ? -0.449 -2.665 7.280 1.00 27.07 ? 29 PRO B CB 1 HETATM 359 C CG . PRO B 1 29 ? -0.871 -3.451 8.474 1.00 29.29 ? 29 PRO B CG 1 HETATM 360 C CD . PRO B 1 29 ? -2.181 -4.081 8.073 1.00 25.15 ? 29 PRO B CD 1 HETATM 361 O OD1 . PRO B 1 29 ? -1.104 -2.513 9.511 1.00 29.55 ? 29 PRO B OD1 1 HETATM 362 N N . GLY B 1 30 ? -1.202 -1.128 4.593 1.00 32.74 ? 30 GLY B N 1 HETATM 363 C CA . GLY B 1 30 ? -1.121 -1.014 3.164 1.00 34.71 ? 30 GLY B CA 1 HETATM 364 C C . GLY B 1 30 ? 0.055 -1.710 2.500 1.00 37.41 ? 30 GLY B C 1 HETATM 365 O O . GLY B 1 30 ? 1.018 -2.175 3.153 1.00 42.14 ? 30 GLY B O 1 HETATM 366 O OXT . GLY B 1 30 ? -0.010 -1.772 1.242 1.00 44.78 ? 30 GLY B OXT 1
Spin
Binding residue
Residue numbering in mmCIF file:
C:
P1 P2 G3 P4 G6 P7 G9 P10 G12 L13 G15 L16 G18 P19 G21 P22 G24 P25 G27 P28
Residue numbering in PDB file:
A:
P1 P2 G3 P4 G6 P7 G9 P10 G12 L13 G15 L16 G18 P19 G21 P22 G24 P25 G27 P28
Receptor
Assembly ID: 2drx_1
Stoichiometry type
: Monomer -A1
Assembly defined by
: Author and software
PDB ID
:
2drx
Experimental method
: X-RAY DIFFRACTION
Resolution
: 1.4 Å
UniProt ID
: N/A
PubMed ID
:
17373653
Ligand
Ligand ID
:
III
Ligand name
: Peptide
Biological relevance
: Relevant
Download
mmCIF Format
Receptor
Ligand
PDB Format
Receptor
Ligand
Ligand ID
Name
III
Peptide
Binding affinity
Experimental affinity
N/A
Surface area (A
2
)
Surface area of receptor
3468.11
Surface area of ligand
3377.18
Surface area of complex
5020.63
Interface area
912.33
Reference
Wei et al,
Q-BioLiP: A Comprehensive Resource for Quaternary Structure-based Protein–ligand Interactions
,
Genomics, Proteomics & Bioinformatics
, 22(1), qzae001, 2024. (
PDF
)