Function Annotation for BL209238




                                                                                          Spin

Receptor

Assembly ID: 5it7_1

Stoichiometry type: Hetero 77-mer
Assembly defined by: Author
PDB ID: 5it7
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.6 Å
UniProt ID: Q6CWJ2 Q6CKV4 Q9Y854 Q6CS71 P38665 Q6CW78 Q6CQM1 Q6CPN9 Q6CPC5 Q6CJL7 Q6CNL2 Q6CRP7 Q6CJK0 Q6CW97 Q6CWU3 Q6CU17 Q875N2 Q6CP75 Q6CQM3 Q6CU44 Q6CW89 Q875M0 Q6CNI7 Q6CKT4 Q6CRR9 Q6CMG3 Q6CWD0 Q6CRZ8 Q6CL71 Q6CPG3 Q6CKL3 Q8J287 Q6CVB1 Q6CLA6 Q6CWM6 Q6CWT9 Q6CX80 P04650 P31027 B4UN96 Q6CXM0 Q6CS01 P38664 Q6CW41 Q6CM20 Q6CW21 Q6CUH5 Q6CJR7 Q6CXQ6 Q6CWR9 Q6CWE7 Q6CRA3 Q6CLU4 Q875M3 Q6CSS8 Q6CVZ5 Q6CL98 Q6CRX7 P27069 Q6CNH9 P48045 Q6CP82 Q6CXL8 Q6CR18 Q6CRK7 P0CX86 Q6CN12 Q6CM18 Q6CIM1 P69061 Q6CXT6 Q6CUW0 Q6CTD6 Q6CM04 P33285
PubMed ID: 27159451

Ligand

Ligand ID: RNA
Ligand name: Ribonucleic acid
Biological relevance: Relevant

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Ligand ID NUC pairing details Name
RNA B:RNA Ribonucleic acid


Binding affinity

Experimental affinity N/A

Surface area (A2)

Surface area of receptor N/A
Surface area of ligand 19910.65
Surface area of complex 19910.65
Interface area N/A
Reference

  • Wei et al, Q-BioLiP: A Comprehensive Resource for Quaternary Structure-based Protein–ligand Interactions, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 22(1), qzae001, 2024. (PDF)