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BLM A 1 . ? -14.049 31.421 -1.082 1.00 0.00 ? 1 BLM A HF2 1 HETATM 111 H HF1 . BLM A 1 . ? -14.016 33.105 -1.208 1.00 0.00 ? 1 BLM A HF1 1 HETATM 112 H HAA . BLM A 1 . ? -10.652 32.756 -0.485 1.00 0.00 ? 1 BLM A HAA 1 HETATM 113 H HAB . BLM A 1 . ? -11.090 33.750 -0.538 1.00 0.00 ? 1 BLM A HAB 1 HETATM 114 H HAC . BLM A 1 . ? -10.289 33.541 0.145 1.00 0.00 ? 1 BLM A HAC 1 HETATM 115 H H13 . BLM A 1 . ? -8.923 34.397 4.855 1.00 0.00 ? 1 BLM A H13 1 HETATM 116 H H14 . BLM A 1 . ? -9.128 34.392 7.370 1.00 0.00 ? 1 BLM A H14 1 HETATM 117 H H28 . BLM A 1 . ? -10.500 33.986 9.623 1.00 0.00 ? 1 BLM A H28 1 HETATM 118 H H29 . BLM A 1 . ? -13.969 32.303 8.138 1.00 0.00 ? 1 BLM A H29 1 HETATM 119 H HNI . BLM A 1 . ? -12.719 32.983 10.141 1.00 0.00 ? 1 BLM A HNI 1 HETATM 120 H HNK . BLM A 1 . ? -9.597 31.258 4.762 1.00 0.00 ? 1 BLM A HNK 1 HETATM 121 H H34 . BLM A 1 . ? -10.588 30.634 7.585 1.00 0.00 ? 1 BLM A H34 1 HETATM 122 H HO2 . BLM A 1 . ? -9.185 27.479 7.672 1.00 0.00 ? 1 BLM A HO2 1 HETATM 123 H H31 . BLM A 1 . ? -7.481 30.415 6.723 1.00 0.00 ? 1 BLM A H31 1 HETATM 124 H HBA . BLM A 1 . ? -6.865 30.194 4.333 1.00 0.00 ? 1 BLM A HBA 1 HETATM 125 H HBB . BLM A 1 . ? -8.332 29.220 4.023 1.00 0.00 ? 1 BLM A HBB 1 HETATM 126 H HBC . BLM A 1 . ? -7.028 28.572 5.068 1.00 0.00 ? 1 BLM A HBC 1 HETATM 127 H H33 . BLM A 1 . ? -9.963 28.788 5.956 1.00 0.00 ? 1 BLM A H33 1 HETATM 128 H HCB . BLM A 1 . ? -9.839 30.582 9.925 1.00 0.00 ? 1 BLM A HCB 1 HETATM 129 H HCC . BLM A 1 . ? -8.642 29.306 9.545 1.00 0.00 ? 1 BLM A HCC 1 HETATM 130 H HCA . BLM A 1 . ? -8.478 30.939 8.824 1.00 0.00 ? 1 BLM A HCA 1 HETATM 131 H HNL . BLM A 1 . ? -12.525 30.170 8.424 1.00 0.00 ? 1 BLM A HNL 1 HETATM 132 H H37 . BLM A 1 . ? -13.283 27.507 9.397 1.00 0.00 ? 1 BLM A H37 1 HETATM 133 H H38 . BLM A 1 . ? -15.616 28.428 9.337 1.00 0.00 ? 1 BLM A H38 1 HETATM 134 H HO3 . BLM A 1 . ? -15.926 30.547 8.883 1.00 0.00 ? 1 BLM A HO3 1 HETATM 135 H HDB . BLM A 1 . ? -15.304 29.833 11.310 1.00 0.00 ? 1 BLM A HDB 1 HETATM 136 H HDC . BLM A 1 . ? -14.043 28.552 11.335 1.00 0.00 ? 1 BLM A HDC 1 HETATM 137 H HDA . BLM A 1 . ? -13.609 30.215 10.849 1.00 0.00 ? 1 BLM A HDA 1 HETATM 138 H HNM . BLM A 1 . ? -12.320 26.437 7.674 1.00 0.00 ? 1 BLM A HNM 1 HETATM 139 H H2E . BLM A 1 . ? -12.582 23.893 5.076 1.00 0.00 ? 1 BLM A H2E 1 HETATM 140 H H2X . BLM A 1 . ? -11.943 24.214 6.689 1.00 0.00 ? 1 BLM A H2X 1 HETATM 141 H H1E . BLM A 1 . ? -13.558 26.253 5.034 1.00 0.00 ? 1 BLM A H1E 1 HETATM 142 H H1X . BLM A 1 . ? -14.287 25.096 6.175 1.00 0.00 ? 1 BLM A H1X 1 HETATM 143 H H44 . BLM A 1 . ? -7.672 26.142 4.484 1.00 0.00 ? 1 BLM A H44 1 HETATM 144 H H47 . BLM A 1 . ? -8.141 29.026 -0.274 1.00 0.00 ? 1 BLM A H47 1 HETATM 145 H HNP . BLM A 1 . ? -9.811 29.699 -1.653 1.00 0.00 ? 1 BLM A HNP 1 HETATM 146 H H501 . BLM A 1 . ? -12.699 30.318 -2.124 1.00 0.00 ? 1 BLM A H501 1 HETATM 147 H H502 . BLM A 1 . ? -11.821 29.310 -3.296 1.00 0.00 ? 1 BLM A H502 1 HETATM 148 H H511 . BLM A 1 . ? -10.261 31.135 -3.816 1.00 0.00 ? 1 BLM A H511 1 HETATM 149 H H512 . BLM A 1 . ? -10.903 32.136 -2.505 1.00 0.00 ? 1 BLM A H512 1 HETATM 150 H H521 . BLM A 1 . ? -13.163 32.281 -3.731 1.00 0.00 ? 1 BLM A H521 1 HETATM 151 H H522 . BLM A 1 . ? -12.452 31.275 -5.030 1.00 0.00 ? 1 BLM A H522 1 HETATM 152 H H551 . BLM A 1 . ? -11.271 34.638 -2.973 1.00 0.00 ? 1 BLM A H551 1 HETATM 153 H H552 . BLM A 1 . ? -12.996 34.716 -3.536 1.00 0.00 ? 1 BLM A H552 1 HETATM 154 H H553 . BLM A 1 . ? -11.718 35.738 -4.313 1.00 0.00 ? 1 BLM A H553 1 HETATM 155 H H541 . BLM A 1 . ? -12.828 34.475 -6.663 1.00 0.00 ? 1 BLM A H541 1 HETATM 156 H H542 . BLM A 1 . ? -13.640 33.780 -5.968 1.00 0.00 ? 1 BLM A H542 1 HETATM 157 H H543 . BLM A 1 . ? -12.921 33.234 -6.864 1.00 0.00 ? 1 BLM A H543 1 HETATM 158 H HO59 . BLM A 1 . ? -9.404 39.476 9.924 1.00 0.00 ? 1 BLM A HO59 1 HETATM 159 H HO58 . BLM A 1 . ? -11.815 36.884 7.024 1.00 0.00 ? 1 BLM A HO58 1 HETATM 160 H H611 . BLM A 1 . ? -8.508 37.230 10.639 1.00 0.00 ? 1 BLM A H611 1 HETATM 161 H H612 . BLM A 1 . ? -9.243 35.648 10.702 1.00 0.00 ? 1 BLM A H612 1 HETATM 162 H HO61 . BLM A 1 . ? -9.970 37.013 12.425 1.00 0.00 ? 1 BLM A HO61 1 HETATM 163 H H60 . BLM A 1 . ? -10.876 36.313 9.038 1.00 0.00 ? 1 BLM A H60 1 HETATM 164 H H63 . BLM A 1 . ? -8.471 36.525 6.192 1.00 0.00 ? 1 BLM A H63 1 HETATM 165 H H57 . BLM A 1 . ? -8.952 38.765 6.882 1.00 0.00 ? 1 BLM A H57 1 HETATM 166 H H58 . BLM A 1 . ? -11.208 39.633 7.326 1.00 0.00 ? 1 BLM A H58 1 HETATM 167 H H59 . BLM A 1 . ? -11.267 38.618 9.617 1.00 0.00 ? 1 BLM A H59 1 HETATM 168 H H69 . BLM A 1 . ? -12.651 38.762 5.337 1.00 0.00 ? 1 BLM A H69 1 HETATM 169 H H68 . BLM A 1 . ? -11.333 36.779 4.416 1.00 0.00 ? 1 BLM A H68 1 HETATM 170 H H67 . BLM A 1 . ? -12.425 37.900 1.801 1.00 0.00 ? 1 BLM A H67 1 HETATM 171 H H65 . BLM A 1 . ? -9.500 37.482 2.598 1.00 0.00 ? 1 BLM A H65 1 HETATM 172 H H64 . BLM A 1 . ? -10.704 40.284 4.825 1.00 0.00 ? 1 BLM A H64 1 HETATM 173 H HO67 . BLM A 1 . ? -11.037 36.217 0.961 1.00 0.00 ? 1 BLM A HO67 1 HETATM 174 H HO69 . BLM A 1 . ? -13.237 40.345 3.999 1.00 0.00 ? 1 BLM A HO69 1 HETATM 175 H HNQ1 . BLM A 1 . ? -13.663 35.666 2.149 1.00 0.00 ? 1 BLM A HNQ1 1 HETATM 176 H HNQ2 . BLM A 1 . ? -13.667 34.001 2.577 1.00 0.00 ? 1 BLM A HNQ2 1 HETATM 177 H HO66 . BLM A 1 . ? -10.041 37.691 -1.011 1.00 0.00 ? 1 BLM A HO66 1 HETATM 178 H H661 . BLM A 1 . ? -9.033 38.995 0.702 1.00 0.00 ? 1 BLM A H661 1 HETATM 179 H H662 . BLM A 1 . ? -10.773 39.265 0.448 1.00 0.00 ? 1 BLM A H662 1 HETATM 180 CO CO . CO B 2 . ? -12.494 32.713 5.044 1.00 0.00 ? 2 CO A CO 1
spin
Assembly
Assembly ID: 1dey_1
Assembly defined by
: Author
PDB ID
:
1dey
Experimental method
: SOLUTION NMR
Resolution
: N/A
UniProt ID
: N/A
PubMed ID
:
10747776
Ligand 1
:
CO
Ligand 2
:
BLM
Download
mmCIF Format
PDB Format
Ligand ID
NUC pairing detail
Ligand Name
Synonyms
Formula
2D structure
CO
N/A
Cobalt(2+)
1: Co(2+); 2: Cobalt (ii) ion; 3: Cobalt(ii) cation; 4: Co2+; 5: Cobalt(2+) ion; 6: Cobaltous ion;
Co
BLM
N/A
Bleomycin a2
1: N(1)-[3-(dimethylsulfonio)propyl]bleomycinamide; 2: Bleomycin; 3: (betar)-n(alpha)-{[6-amino-2-((1s)-3-amino-1-{[(2s)-2,3-diamino-3-oxopropyl]amino}-3-oxopropyl)-5-methylpyrimidin-4-yl]carbonyl}-beta-{2-o-[3-o-(aminocarbonyl)-alpha-d-mannopyranosyl]-alpha-l-gulopyranosyloxy}-n-[(1r,2s,3s)-5-({(1s,2r)-1-[({2-[4-({[3-(dimethylsulfonio)propyl]amino}carbonyl)-2,4'-bi-1,3-thiazol-2'-yl]ethyl}amino)carbonyl]-2-hydroxypropyl}amino)-3-hydroxy-4-methyl-5-oxopentan-2-yl]-l-histidinamide; 4: N1-[3-(dimethylsulfonio)-propyl]bleomycinamide;
"C55 H85 N17 O21 S3"
Reference
Wei et al,
Q-BioLiP: A Comprehensive Resource for Quaternary Structure-based Protein–ligand Interactions
,
Genomics, Proteomics & Bioinformatics
, 22(1), qzae001, 2024. (
PDF
)
